1,482 research outputs found

    Impacts of China’s growth on the Brazilian trade

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    We evaluate whether the presence of China in world trade is ultimately beneficial or whether it is a threat to Brazil. Using a gravitational model and a panel data method, we find that the Chinese exports to countries other than Brazil are not hurting the Brazilian exports, although the exports of Brazilian manufactured goods have been displaced by commodities as a result of its commerce with China.Brazil; China; trade; gravitational model

    Compressão eficiente de sequências biológicas usando uma rede neuronal

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    Background: The increasing production of genomic data has led to an intensified need for models that can cope efficiently with the lossless compression of biosequences. Important applications include long-term storage and compression-based data analysis. In the literature, only a few recent articles propose the use of neural networks for biosequence compression. However, they fall short when compared with specific DNA compression tools, such as GeCo2. This limitation is due to the absence of models specifically designed for DNA sequences. In this work, we combine the power of neural networks with specific DNA and amino acids models. For this purpose, we created GeCo3 and AC2, two new biosequence compressors. Both use a neural network for mixing the opinions of multiple specific models. Findings: We benchmark GeCo3 as a reference-free DNA compressor in five datasets, including a balanced and comprehensive dataset of DNA sequences, the Y-chromosome and human mitogenome, two compilations of archaeal and virus genomes, four whole genomes, and two collections of FASTQ data of a human virome and ancient DNA. GeCo3 achieves a solid improvement in compression over the previous version (GeCo2) of 2:4%, 7:1%, 6:1%, 5:8%, and 6:0%, respectively. As a reference-based DNA compressor, we benchmark GeCo3 in four datasets constituted by the pairwise compression of the chromosomes of the genomes of several primates. GeCo3 improves the compression in 12:4%, 11:7%, 10:8% and 10:1% over the state-of-the-art. The cost of this compression improvement is some additional computational time (1:7_ to 3:0_ slower than GeCo2). The RAM is constant, and the tool scales efficiently, independently from the sequence size. Overall, these values outperform the state-of-the-art. For AC2 the improvements and costs over AC are similar, which allows the tool to also outperform the state-of-the-art. Conclusions: The GeCo3 and AC2 are biosequence compressors with a neural network mixing approach, that provides additional gains over top specific biocompressors. The proposed mixing method is portable, requiring only the probabilities of the models as inputs, providing easy adaptation to other data compressors or compression-based data analysis tools. GeCo3 and AC2 are released under GPLv3 and are available for free download at https://github.com/cobilab/geco3 and https://github.com/cobilab/ac2.Contexto: O aumento da produção de dados genómicos levou a uma maior necessidade de modelos que possam lidar de forma eficiente com a compressão sem perdas de biosequências. Aplicações importantes incluem armazenamento de longo prazo e análise de dados baseada em compressão. Na literatura, apenas alguns artigos recentes propõem o uso de uma rede neuronal para compressão de biosequências. No entanto, os resultados ficam aquém quando comparados com ferramentas de compressão de ADN específicas, como o GeCo2. Essa limitação deve-se à ausência de modelos específicos para sequências de ADN. Neste trabalho, combinamos o poder de uma rede neuronal com modelos específicos de ADN e aminoácidos. Para isso, criámos o GeCo3 e o AC2, dois novos compressores de biosequências. Ambos usam uma rede neuronal para combinar as opiniões de vários modelos específicos. Resultados: Comparamos o GeCo3 como um compressor de ADN sem referência em cinco conjuntos de dados, incluindo um conjunto de dados balanceado de sequências de ADN, o cromossoma Y e o mitogenoma humano, duas compilações de genomas de arqueas e vírus, quatro genomas inteiros e duas coleções de dados FASTQ de um viroma humano e ADN antigo. O GeCo3 atinge uma melhoria sólida na compressão em relação à versão anterior (GeCo2) de 2,4%, 7,1%, 6,1%, 5,8% e 6,0%, respectivamente. Como um compressor de ADN baseado em referência, comparamos o GeCo3 em quatro conjuntos de dados constituídos pela compressão aos pares dos cromossomas dos genomas de vários primatas. O GeCo3 melhora a compressão em 12,4%, 11,7%, 10,8% e 10,1% em relação ao estado da arte. O custo desta melhoria de compressão é algum tempo computacional adicional (1,7 _ a 3,0 _ mais lento do que GeCo2). A RAM é constante e a ferramenta escala de forma eficiente, independentemente do tamanho da sequência. De forma geral, os rácios de compressão superam o estado da arte. Para o AC2, as melhorias e custos em relação ao AC são semelhantes, o que permite que a ferramenta também supere o estado da arte. Conclusões: O GeCo3 e o AC2 são compressores de sequências biológicas com uma abordagem de mistura baseada numa rede neuronal, que fornece ganhos adicionais em relação aos biocompressores específicos de topo. O método de mistura proposto é portátil, exigindo apenas as probabilidades dos modelos como entradas, proporcionando uma fácil adaptação a outros compressores de dados ou ferramentas de análise baseadas em compressão. O GeCo3 e o AC2 são distribuídos sob GPLv3 e estão disponíveis para download gratuito em https://github.com/ cobilab/geco3 e https://github.com/cobilab/ac2.Mestrado em Engenharia de Computadores e Telemátic

    Impacts of China’s growth on the Brazilian trade

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    We evaluate whether the presence of China in world trade is ultimately beneficial or whether it is a threat to Brazil. Using a gravitational model and a panel data method, we find that the Chinese exports to countries other than Brazil are not hurting the Brazilian exports, although the exports of Brazilian manufactured goods have been displaced by commodities as a result of its commerce with China

    Trehalose biosynthesis in Thermus thermophilus RQ-1: biochemical properties of the trehalose-6-phosphate synthase and trehalose-6-phosphate phosphatase

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    The genes for trehalose synthesis in Thermus thermophilus RQ-1, namely otsA [trehalose-phosphate synthase (TPS)], otsB [trehalose-phosphate phosphatase (TPP)], and treS [trehalose synthase (maltose converting) (TreS)] genes are structurally linked. The TPS/TPP pathway plays a role in osmoadaptation, since mutants unable to synthesize trehalose via this pathway were less osmotolerant, in trehalose-deprived medium, than the wild-type strain. The otsA and otsB genes have now been individually cloned and overexpressed in Escherichia coli and the corresponding recombinant enzymes purified. The apparent molecular masses of TPS and TPP were 52 and 26 kDa, respectively. The recombinant TPS utilized UDP-glucose, TDP-glucose, ADP-glucose, or GDP-glucose, in this order as glucosyl donors, and glucose-6-phosphate as the glucosyl acceptor to produce trehalose-6-phosphate (T6P). The recombinant TPP catalyzed the dephosphorylation of T6P to trehalose. This enzyme also dephosphorylated G6P, and this activity was enhanced by NDP-glucose. TPS had an optimal activity at about 98°C and pH near 6.0; TPP had a maximal activity near 70°C and at pH 7.0. The enzymes were extremely thermostable: at 100°C, TPS had a half-life of 31 min, and TPP had a half-life of 40 min. The enzymes did not require the presence of divalent cations for activity; however, the presence of Co 2+ and Mg 2+ stimulates both TPS and TPP. This is the first report of the characterization of TPS and TPP from a thermophilic organism

    Flora da Serra do Cipó, Minas Gerais: Sapindacea

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    O estudo da família Sapindaceae é parte do levantamento da Flora da Serra do Cipó, Minas Gerais, Brasil. A família está representada na área por 39 espécies distribuídas em 10 gêneros: Allophylus, Cardiospermum, Cupania, Dilodendron, Dodonaea, Matayba, Magonia, Paullinia, Serjania e Toulicia. São apresentadas chaves para os gêneros e espécies, descrições e ilustrações das mesmas, além de comentários sobre sua distribuição geográfica, fenologia e variabilidade morfológica.The study of the family Sapindaceae is a part of the Project of “Flora of Serra do Cipó, Minas Gerais, Brazil”. The family is represented there by 39 species distributed in 10 genera: Allophylus, Cardiospermum, Cupania, Dilodendron, Dodonaea, Matayba, Magonia, Paullinia, Serjania and Toulicia. Keys to genera and species, descriptions and illustrations, as well as comments on the geographic distribution, phenology and morphological variability of the species are presented.Fil: da Silva, Katia Freire. Universidade de Sao Paulo; Brasil;Fil: Ferrucci, Maria Silvia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico - Conicet - Nordeste. Instituto de Botanica del Nordeste (i); Argentina;Fil: Groppo, Milton. Universidade de Sao Paulo; Brasil

    Vigilância em saúde

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    Este módulo pretende instrumentalizar o grupo para desenvolver ações planejadas e programadas a partir da notificação de doenças e agravos, visando o aprimoramento da assistência na atenção básica de saúde. Para isto, contaremos com quatro unidades que abordarão os temas necessários para alcançar nossos objetivos.1.0Ministério da Saúde/OPAS/OM

    Simulação virtual como estratégia facilitadora da aprendizagem significativa de fenômenos científicos : uma aplicação à óptica geométrica no estudo da refração em nível de ensino médio

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    Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Decanato de Pesquisa e Pós-Graduação, Instituto de Ciências Biológicas, Instituto de Física, Instituto de Química, 2009.Este projeto trata do desenvolvimento e aplicação de um material instrucional interativo com o uso dos Java Applets que versam sobre o estudo da Refração. Elaborado com a intenção de promover a aprendizagem significativa em nível de ensino médio, o estudo foi realizado no segundo bimestre do ano 2008, em duas turmas do segundo ano do ensino médio, sendo uma delas o grupo experimental e a outra o grupo testemunha, no Colégio e Faculdade Santa Terezinha, em Taguatinga, Distrito Federal. Para a elaboração deste material nos fundamentamos nas bibliografias pertinentes ao tema e, especialmente, na teoria da aprendizagem significativa de David Ausubel. O material é composto de três aulas em PowerPoint e três atividades com o uso dos Java Applets. Os resultados da pesquisa mostram que o recurso utilizado conseguiu cumprir com o objetivo de promover a aprendizagem significativa, proporcionando uma interação do estudante com o objeto do conhecimento através da interatividade dos mesmos com a nova metodologia de ensino, fazendo com que esse estudante fosse parte integrante do processo de aquisição do conhecimento. Como produto final dessa pesquisa, foi elaborado um material instrucional de apoio ao professor na intenção de colaborar com melhoria do ensino da Física em nível médio. _________________________________________________________________________________________ ABSTRACTThis project deals with the development and implementation of an interactive instructional material with the use of Java Applets, about the study of Refraction. Prepared with the intention of promoting meaningful learning in high school level, the study was conducted in the second term of the year 2008, in two classes of the second year of high school, being one of them the experimental group and the other, the control group, in the College and School Santa Terezinha in Taguatinga, Distrito Federal. To produce this material we based the study in bibliographies relevant to the subject and, especially, in the meaningful learning theory of David Ausubel. The material is composed of three lessons in PowerPoint, and three activities with the use of Java Applets. The survey results show that the resource used, could promote meaningful learning, providing a student interaction with the object of knowledge through their interaction with the new methodology of teaching, so that the student was an integral part of the acquisition of knowledge process. As a final product of this research, an instructional material was developed to support teachers in order to collaborate with the improvement of the Physics’ teaching in high school

    A progressão referencial-anafórica na fala cotidiana

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    Orientador : Iara Bemquerer CostaDissertação (mestrado) - Universidade Federal do Paraná. Setor de Ciências Humanas, Letras e Artes. Curso de Pós-Graduação em Letras. Defesa: Curitiba, 13/04/2004Inclui bibliografiaÁrea de concentração : Estudos linguísticosResumo : O presente estudo insere-se no campo da Lingüística de Texto, tendo como cerne de discussão o processo referencial e anafórico na produção de texto oral. Objetiva-se compreender como se dá a progressão referencial na fala cotidiana. Assume-se como conceito principal o de referenciação defendido por Mondada e Dubois (2003), o qual implica compreender o referente como objeto de discurso, isto é. como objeto construído textualmente. Desse modo. o referente, uma vez introduzido 110 texto, pode ser abandonado, reativado, enriquecido, fragmentado, levando em conta, por exemplo, aspectos léxicoestereotípicos. a negociação dos interlocutores, o contexto situacional. conhecimentos de língua e de mundo compartilhado. Outro conceito crucial é o de anáfora, o qual é exposto a partir de Marcuschi e Koch (2002), ao proporem uma noção ampliada para o fenômeno anafórico. Conforme essa proposição, o elemento anafórico, na busca de construir seu referente, pode-se ancorar em um item lexical explícito no cotexto antecedente ou subseqüente, pode-se ancorar em informações difusas cotextualmente. ou ainda, seu referente pode-se constituir sem a presença dessas informações. A hipótese assumida aqui é a de que a anáfora, entendida de modo ampliado, é uma estratégia utilizada na construção de objetos de discurso e no processo de progressão referencial. Como corpus utiliza-se de textos extraídos do Banco de Dados Lingüísticos do VARSUL - Variação Lingüística Urbana na Região Sul do Brasil.Abstract : This dissertation in the Text Linguistics field discusses the referential and anaphoric process in oral text production. It aims to understand how the referential progression in everyday speech works. It's assumed the referenciation in the terms of Mondada and Dubois (2003) as the main conception, which implies the referent as a discourse object i.e. it is built textually. In this way. the referent introduced in the text may be abandoned, reactivated, enriched, fragmented, taking into account, for instance, the pre-textual word meaning, interlocutor negotiation, situational context, knowledge of language, world and shared world knowledge. The discourse object construction does not depend on a correspondent object existence in the real and extra-textual world. Another crucial conception is anaphora, exposed by Marcuschi and Koch (2002), in their proposal of an extended conception for this phenomenon. According to them, the anaphoric element, when building its referent, may be hooked in an explicit lexical item in the previous cotext or in the subsequent one. It also .may be hooked in cotextuallv difused information, or even the referent can be built without the presence of any of that information. The hypothesis assumed in this study is that the anaphora, in such an extended view, is a strategy used in the discourse object construction and in the referential progression process. It is used corpus texts from the VARSUL (Urban Language Variation in Brazil's South Region) Data Base
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